生统爱好者周刊（第 12 期）：上半年中国发表 NC 论文全球第一，OA 费用共计超 1.3 亿

biostat weekly issue 12
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Author

Zhen Lu

Published

Friday, December 12, 2025

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本周话题：上半年中国发表 NC 论文全球第一，OA 费用共计超 1.3 亿

中国科研机构在追求国际学术认可的道路上，正通过一本名为Nature Communications《自然通讯》的期刊，支付着令人瞩目的经济成本。根据 Web of Science 数据，2025 年 1 月至 6 月，《Nature Communications》共发表 6350 篇研究论文，其中中国作者 2672 篇，居首位，美国 2409 篇，德国 925 篇。该开放获取期刊影响因子 15.7，每篇论文版面费 6990 美元（约 5 万元人民币）。据此估算，今年上半年中国学者在该刊发表论文的总支出约 1.339 亿元人民币。

生统研究

  1. Lancet Public Health | 中国提高烟草、酒精及含糖饮料税收所能带来的健康、经济与财政效益

该研究系统量化了提高中国烟草、酒精及含糖饮料税收所能带来的健康、经济与财政效益，是国内首个从健康—经济双重视角开展的综合评估。结果显示：适度的税率提升即可显著减少疾病负担、延长预期寿命，并带来可观的财政收入，同时显著改善低收入人群的健康结果，具有明显的公平性效应。这些证据表明，提高健康相关税收是实现“健康中国2030”目标与缓解人口老龄化带来财政压力的可行路径。

  • 论文 DOI：10.1016/S2468-2667(25)00256-7
  1. JAMA Network Open | 孤独的童年，会让大脑提前衰老

本研究使用了CHARLS的全国代表性数据来调查儿童孤独与成年中后期认知能力下降和痴呆的长期关系，并探索了成人孤独是否改变或介导了这些关联。研究发现：童年孤独（经常感到孤独且缺少亲密朋友）与成年后更快的认知衰退和更高的痴呆风险显著相关，即使成年后并不孤独，这种影响仍然存在。成年期孤独只解释了部分关联，提示减少童年孤独的早期干预，或是终身认知健康与预防痴呆的重要起点。

  • 论文 DOI：10.1001/jamanetworkopen.2025.31493
  1. Nature Human Behaviour | PIGEON——评估多基因性状GxE的新型统计框架

理解基因-环境互作（GxE）对于解析人类复杂性状的遗传结构至关重要。然而，当前的GE统计推断方法在可扩展性和可解释性方面均面临挑战。本文提出PIGEON，一种采用方差成分分析方法的多基因GE量化统一的统计框架。基于该框架，本研究系统阐述了GE研究的主要目标，并开发了仅需输入汇总统计学数据的估计策略。通过理论推导和实证分析（涵盖健康结局的基因-教育互作准实验研究、UK Biobank中530个性状的基因-性别互作分析）验证了PIGEON的有效性，同时在戒烟干预临床试验中识别了可解释治疗效应异质性的遗传互作元件。该框架为未来GE研究提供了一种基于汇总统计的多基因推断新范式。

  • 论文 DOI：10.1038/s41562-025-02202-9

博文资讯

  1. 《Nature》2025年度十大人物榜单正式揭晓：两名中国学者入选

2025年12月9日，国际顶尖学术期刊《Nature》在官网发布“年度十大人物”榜单，两名中国学者入选，分别是：DeepSeek创始人梁文锋以及中国科学院深海科学与工程研究所杜梦然。其他8位分别是：美国加州大学戴维斯分校物理学家Tony Tyson、以色列魏茨曼科学研究所系统生物学家Yifat Merbl、英国伦敦大学学院神经学家Sarah Tabrizi、接受一种新型基因编辑疗法的美国费城郊区患儿KJ Muldoon、印度数据科学家Achal Agrawal、巴西奥斯瓦尔多·克鲁兹基金会农业研究员Luciano Moreira、南非金山大学公共卫生官员Precious Matsoso以及美国微生物学家和免疫学家Susan Monarez。

  1. 全球衰老研究热潮：46万篇论文揭示神经健康新前沿

全球范围内，衰老研究正迎来前所未有的热潮：截至目前已发表约46万篇相关论文，美国、中国、英国产出领先，哈佛等顶尖机构处于第一梯队。神经与认知健康是该领域的关键关注方向，研究重点集中在五大子主题，包括神经退行性疾病机制、失智症的护理与干预和认知障碍评估等方向。

工具

  1. R 语言新包hmmTMB

Journal of Statistical Software 在近期发表了一篇关于隐马尔可夫模型（HMM）的文章，其中介绍了一个可以灵活处理协变量的R包：hmmTMB。该包基于隐马尔可夫模型，可处理多种观测类型，支持非线性协变量、随机效应、复杂依赖结构，并提供拟合、状态解码、模型诊断与可视化等功能，在疾病进展建模、活动监测和金融时间序列等应用中表现出较强实用性。

  1. UKB DNAnexus 平台官方文档介绍

UKB DNAnexus 平台官方文档介绍，涵盖数据使用下载常见问题。

资源

  1. 9 个优质开源 GitHub 项目

9 个高质量 GitHub 开源项目：本地 PDF 全能工具 Stirling-PDF、开源设计协作平台 Penpot、知识大纲管理 Outline、IT 团队文档系统 MinDoc、学术 PDF 阅读器 Sioyek、多语言漫画翻译器 comic-translate、K8s 可观测性工具 Pixie、高性能 Web 框架 FastAPI，以及强大的 Windows Terminal，覆盖办公、研发、运维到阅读全场景，值得收藏尝试。

  1. 10个常用的分析绘图R包

推荐 10 个高频绘图包，覆盖热图、差异分析、富集与趋势、雷达与云雨图、地图、韦恩图及基因结构可视化。

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